Los trócares también se utilizan cerca del final del proceso de embalsamamiento para proporcionar drenaje de fluidos corporales y órganos después del reemplazo vascular de sangre con productos químicos para embalsamar. En lugar de insertar un tubo redondo, el cuchillo de tres lados del trócar clásico dividiría la piel exterior en tres "alas" que luego se suturarían fácilmente para cerrarlas de una manera menos intrusiva. Está conectado a una manguera de succión (que generalmente está conectada a un aspirador de agua). El proceso de eliminar gases, fluidos y semisólidos de las cavidades corporales y los órganos huecos utilizando el trócar se conoce como aspiración. El instrumento se inserta en el cuerpo dos pulgadas a la izquierda y dos pulgadas hacia arriba desde el ombligo. Después de que se hayan aspirado las cavidades torácica, abdominal y pélvica, el embalsamador inyecta líquido de la cavidad en las cavidades torácica, abdominal y pélvica utilizando un trócar más pequeño conectado a través de una manguera que está conectada a una botella de líquido de cavidad de alto índice. El frasco se mantiene boca abajo en el aire para que la gravedad lleve el líquido de la cavidad a través del trocar y hacia las cavidades. El embalsamador mueve el trocar de la misma manera que lo hizo al aspirar las cavidades para distribuir el producto químico de manera completa y uniforme.
Una vez finalizado el embalsamamiento de la cavidad, la punción generalmente se sella utilizando un pequeño objeto de plástico parecido a un tornillo, llamado botón de trocar.
Los veterinarios utilizan ampliamente los trócares no solo para drenar hidrotórax, ascitis o para introducir instrumentos en cirugía laparoscópica, sino también para afecciones agudas específicas de los animales. En casos de timpanismo ruminal (hinchazón) en el ganado, se puede pasar un trócar de gran calibre a través de la piel hasta el rumen para liberar el gas atrapado. En los perros, a menudo se realiza un procedimiento similar para pacientes que presentan GDV (dilatación gástrica-vólvulo) en el que se pasa un trócar de gran calibre a través de la piel hasta el estómago para descomprimirlo inmediatamente. Dependiendo de la gravedad de los signos clínicos en el momento de la presentación, esto a menudo se realiza después de que se haya administrado el tratamiento del dolor pero antes de la anestesia general. El tratamiento quirúrgico definitivo implica el reposicionamiento anatómico del estómago y el bazo seguido de una gastropexia del lado derecho. Dependiendo de la gravedad, puede estar indicada una gastrectomía parcial y/o esplenectomía si los tejidos relevantes se han necrosado debido a la isquemia causada por torsión/avulsión de la vasculatura que los irriga. Se recomienda enfáticamente un tratamiento de apoyo posoperatorio de 72- horas, fluidoterapia y monitorización del ECG para detectar arritmias cardíacas.

